Het Dr. Mollercollege heeft twee afdelingen: havo en vwo (zowel atheneum als gymnasium).

Brugklas
Voor een goede start naar het VO besteden wij veel aandacht aan de introductie van brugklassers. Tijdens hun laatste jaar op de basisschool kunnen de leerlingen een speciaal introductieprogramma volgen. Het Dr. Mollercollege heeft vier typen brugklassen. Na het eerste jaar hebben brugklasleerlingen de mogelijkheid om over te stappen naar een andere richting.
- Brugklas havo-vwo
- Brugklas havo-vwo tweetalig onderwijs (TTO)
- Brugklas atheneum-gymnasium
- Brugklas atheneum-gymnasium tweetalig onderwijs (TTO)

In de brugklas volgen alle leerlingen dezelfde vakken. Indien mogelijk zitten leerlingen van dezelfde basisschool of uit dezelfde woonplaats bij elkaar. In periode 1 en 2 hebben de leerlingen twee mentoruren onder meer voor begeleiding bij leren leren. De leerlingen krijgen in de les werktijd om opdrachten te maken. Opdrachten die niet af zijn, moeten thuis afgemaakt worden, Lentoren (leerlingmentoren) kunnen hierbij ook helpen. Leerlingen van een vwo-brugklas volgen het hele jaar 2 uur Latijn per week. Leerlingen uit de havo/vwo-brugklassen die de interesse en de capaciteiten hebben voor gymnasium kunnen in de vierde periode lessen Latijn volgen en aan het eind van het schooljaar eventueel doorstromen naar het gymnasium.

Doorstroom na de brugklas
In de onderbouw (klas 1, 2, 3) en 4 vwo volgen de leerlingen het Programma van Toetsing voor de Onderbouw (PTO). Het betekent dat leerlingen in een vaste periode werken aan een vooraf vastgestelde reeks leerdoelen. Vooraf is helder welke doelen zij moeten behalen, welke activiteiten daarbij horen en op welke manier deze periode wordt afgesloten. Ook is bekend hoe de beoordeling plaatsvindt en welk cijfer hieruit voortkomt.
Om de toetsdruk te verminderen en de nadruk te leggen op het leren, neemt elk vak in iedere jaarlaag en niveau in principe maximaal vier toetsen per jaar af. Aan het einde van periode 2, halverwege het schooljaar, wordt er op basis van de resultaten en persoonlijke ontwikkeling van het kind een voorlopig besluit genomen over het vervolg van de opleiding. In de vwo brugklas bepaalt de mentor in overleg met de docent klassieke talen welke doorstroomrichting voor klas 2 het beste past bij de leerling. Op basis van interesse, inzet en resultaten wordt een voorstel gedaan voor gymnasium of atheneum. Mocht de leerling zijn opleiding op het Dr. Mollercollege niet kunnen vervolgen, dan wordt er geadviseerd om voor 1 april contact op te nemen met de ontvangende school, die het gewenste niveau aanbiedt. De mentor informeert ouders hierover. Aan het eind van het jaar neemt het docententeam een definitief besluit. De bevorderingsnormen zijn in te zien op het ouderportaal.

Leerjaar 2
In leerjaar 2 komt het vak natuurkunde erbij op de lessentabel, de gymnasiumleerlingen krijgen naast Latijn ook Grieks.  In klas 2 volgen de leerlingen ook het Programma van Toetsing voor de Onderbouw (PTO). Aan het einde van periode 2, halverwege het schooljaar, wordt er op basis van de resultaten en persoonlijke ontwikkeling van uw kind een voorlopig besluit genomen over het vervolg van de opleiding.

Leerjaar 3
In de derde klas wordt scheikunde als een nieuw vak aangeboden. Ook voor dit schooljaar geldt dat de leerlingen het Programma van Toetsing voor de Onderbouw (PTO) volgen. Verder staat dit schooljaar in het teken van de profielkeuze. Halverwege het schooljaar bepaalt de leerling welk profiel hij in de bovenbouw wil volgen. Wij bieden vier profielen aan: economie&maatschappij, cultuur&maatschappij, natuur&gezondheid en natuur&techniek. Gymnasiumleerlingen kiezen na periode 2 voor Latijn of Grieks en volgen één van deze twee vakken in periode 3. Op onze school kan een leerling veel verschillende combinaties van vakken kiezen. Bij het succesvol afronden van dit derde schooljaar heeft de leerling een breed georiënteerde basis om in de bovenbouw te starten.

Bij de overgang wegen zowel alle cijfers als de persoonlijke ontwikkeling mee. Eind periode 2 neemt het docententeam een voorlopig besluit over de best passende doorstroomrichting. Mocht de leerling zijn opleiding op het Dr. Mollercollege niet kunnen vervolgen, dan wordt er geadviseerd om voor 1 april contact op te nemen met de ontvangende school, die het gewenste niveau aanbiedt. Aan het eind van het jaar neemt het docententeam een definitief besluit.

Extra vak
Het is mogelijk om vanaf klas 4 een extra vak te kiezen onder de volgende voorwaarden:
- leerlingen maken hun keuze uiterlijk 6 weken voor de laatste dag van het schooljaar kenbaar;
- het gemiddelde van het tweede rapport in klas 3 is minstens 7,0. Daarnaast kan het volgen van een extra vak waardevol zijn voor leerlingen die de ambitie hebben om van havo door te stromen naar het vwo.
- voordat deze leerlingen naar havo 5, vwo 5 of vwo 6 gaan, geven zij uiterlijk 6 weken voor de laatste lesdag van dat schooljaar aan of ze het extra vak willen continueren;
- gymnasiumleerlingen kunnen later de overstap maken naar het atheneum. Hiervoor moeten ze een extra moderne vreemde taal kiezen (Duits of Frans), om een volledig VWO-pakket te hebben.  
- organisatorisch kan de leerling het extra keuzevak uitsluitend volgen door uren te ‘sprokkelen’, wat betekent dat de lessen niet in het rooster komen. De leerling kan – als het eigen rooster en de groepsgrootte van het cluster dat toelaten – aanschuiven bij andere lesgroepen om de lessen te volgen.

Meer informatie is te vinden in de profielkeuzegids binnen (LINK) het leerlingenportaal.


Leerjaar 4
In klas 4 starten havoleerlingen met het Programma van Toetsing en Afsluiting (PTA). Dat betekent dat alle toetsen meetellen voor het schoolexamen (en dus worden meegenomen naar het examenjaar). Nieuw in havo 4 zijn de vakken CKV en maatschappijleer. Deze vakken worden – net als levensbeschouwing – afgesloten in klas 4. Samen met het profielwerkstuk, waarmee ze in leerjaar 4 starten, leveren deze vakken uiteindelijk het combinatiecijfer op.

Op de havo kunnen leerlingen in klas 4 kiezen voor twee vakken die nieuw zijn in het aanbod van het Dr. Mollercollege: bewegen, sport en maatschappij (BSM) en de praktijkhavo (HavoP). BSM benadert sport en beweging op een praktische, theoretische en organisatorische manier, HavoP geeft leerlingen de mogelijkheid om grote opdrachten zoveel mogelijk écht in praktijk te brengen, vaak in samenwerking met externe partijen.

Vwo-leerlingen krijgen in klas 4 voor de meeste vakken PTO-toetsen (Programma van Toetsing voor de Onderbouw). De vakken maatschappijleer en CKV (atheneum) kennen een PTA en worden dit jaar afgerond. De resultaten hiervan tellen – net als op de havo – mee voor het schoolexamen en vormen onderdeel van een combinatiecijfer.

Leerjaar 5
Havoleerlingen ronden dit jaar het profielwerkstuk af en doen examen. Zij ronden alle PTA-onderdelen af en bereiden zich voor op het centraal eindexamen. Hierna kan de leerling doorstromen naar het hbo. Het is ook mogelijk met een havodiploma door te stromen naar 5 atheneum.

Vwo-leerlingen werken in leerjaar 5 voor alle vakken met het PTA. Dat betekent dat alle toetsen in leerjaar 5 meetellen in het schoolexamendossier. Het vak levensbeschouwing wordt in vwo 5 afgerond. Er wordt dit jaar een start gemaakt met het profielwerkstuk dat ook meetelt voor het combinatiecijfer.

Leerjaar 6
Vwo-leerlingen doen dit jaar examen. Zij ronden hun profielwerkstuk af en presenteren dit aan hun ouders en aan leerlingen uit vwo 5. In dit jaar maken zij schoolexamens en het centraal examen. Hierna kan de leerling doorstromen naar de universiteit.

Versnellen
Leerlingen kunnen in het voorexamenjaar al examen doen in een bepaald vak (of vakken). Dit gaat altijd in overleg met de vakdocent.
De leerling doet dan het PTA van de laatste twee jaar in 1 jaar en op het eind van dat jaar examen.
In het examenjaar kan de leerling de vrijgekomen tijd gebruiken als extra voorbereiding voor andere vakken, een havo-leerling kan ervoor kiezen het vak op vwo-niveau te doen.

Toetsplanning en herkansing
In de onderbouw ontvangen leerlingen gedurende het schooljaar maximaal zes cijfers. Een deel van de toetsen wordt afgenomen tijdens twee toetsweken, namelijk na periode 2 en 4. De overige toetsen worden verspreid over het jaar afgenomen.

In vwo 4 werken we met vier toetsweken en ontvangen leerlingen in beginsel vier cijfers per vak. In dit leerjaar starten ook de eerste schoolexamens volgens het PTA.

In havo 4 en 5 en vwo 5 en 6 vindt de toetsing volledig plaats volgens het PTA. Formatief handelen blijft ons uitgangspunt en tegelijkertijd kunnen herkansingen een positief effect hebben op de resultaten van leerlingen. Na periode 2 is er een centraal herkansingsmoment, waarin een onderbouwleerling één toets van de toetsweek naar keuze mag herkansen. De vakgroepen geven vooraf aan of de toets van de toetsweek herkansbaar is. Voor vwo 4 geldt ten aanzien van dit centrale moment een aanvullende afspraak: voor de vakken CKV, levensbeschouwing en maatschappijleer gelden de herkansingsafspraken zoals deze in het PTA zijn vastgelegd. Voor de overige vakken in vwo 4 geldt hetzelfde als voor klas 1, 2 en 3. Buiten deze centrale mogelijkheid kan een vakgroep in bijzondere gevallen besluiten andere PTO-toetsen herkansbaar te maken.